在胜利在望之际，郑成功迟延了进攻时机，在清廷后续援军的反攻之下惨遭失败，沿长江东撤，转海道南下，9月退回金、厦基地。郑成功北伐失败后，清王朝已控制了中国的大部分国土。
鉴于敌我力量的悬殊和全国客观形势的变化，仅凭金、厦两岛将危在旦夕，郑成功决定东征台湾，利用海峡天险和海上力量的优势，建立新的抗清基地。
1661年4月21日郑成功率 名将士，乘350余艘战舰，从金门料罗湾出师东征。因遇暴风雨在澎湖停留数日，30日拂晓从台南鹿耳门胜利登陆，击溃了荷军的狙击，并乘势攻下赤嵌城。
随后，郑成功率大军包围了荷兰人在台湾的统治中心——热兰遮城。
荷兰驻台湾长官揆一拒绝投降，凭藉坚固的城墙工事负隅顽抗，郑成功数度强攻未果，乃改为长期围困。7月中旬，荷兰援军从巴达维亚支援台湾，在海上决战中被郑成功水师击败。
经过长达九个月的围困，1662年2月1日，揆一终于向郑成功投降，率残兵败卒撤出台湾，至此，荷兰殖民者对台湾达长38年的统治宣告结束，台湾重新回到中国的怀抱,郑成功收复台湾的壮举,为祖国和人民立下了不朽的丰功伟绩。
郑成功在台期间，加强了政治经济建设，置府县、务屯垦、废苛税、兴学校，改善军民关系，安抚台湾土着，颁布了各种法令和条例，为台湾经济社会的发展打下了基础。
1662年6月23日（农历5月初八）。
郑成功因病在台湾去世，时年39岁，葬于台南州仔尾。在清朝统一台湾后，康熙川八年（1699年），帝赐迁葬在南安郑氏祖墓。
康熙帝并题写挽联赞曰：“四镇多贰心，两岛屯师敢向东南争半壁；诸王无寸土，一隅抗志方知海外有孤忠。”
自清朝开始，汉人被称奴才，从此被驯化成一群不知廉耻，道德沦丧，好死不如赖活的一群人，
再也生不出岳飞那样的民族英雄。中国五千年受野蛮人侵略次数太多太多了，膻骚之俗浸染华夏，汉唐君臣之礼，民族文化，精神道统，士人气节只能在古装沪剧中找到。
沪剧《郑成功》 唱词：
沿着江山起起伏伏温柔的曲线，
放马爱的中原爱的北国和江南。
面对冰刀雪剑风雨多情的陪伴，
行军打仗，餐风露宿和内心的感情，
珍惜苍天赐给我的金色的华年。
做人一地肝胆 ，做人何惧艰险， 豪情不变年复一年。
做人有苦有甜 ，善恶分开两边， 都为梦中的明天。
力挽狂澜拯救汉人江山，
血淹没人间 安得太平美满。
我真的还想再活五百年，
我真的还想再活五百年。
郑成功38岁早逝，抗虏未成，留下慷慨遗憾！
郑成功，是在南明末年击退荷兰侵略者，收复台湾的民族英雄。
历史上的郑成功，并非只是一个普通的将领，他的背后依靠的是海商中的龙头老大\"郑氏家族\"。
郑氏家族发家于素来以\"海禁\"着称的明朝，是活跃在东南沿海地区的\"海商\"。当然，在禁止海上贸易的朝廷看来，郑氏家族不是海商，而是海贼。
彼时世界正处于大航海时代，荷兰已经完成了自己的伟大航路，将印尼的香料群岛当作了自家的后花园。香料养肥了荷兰这个不足河南省面积1\/4大的\"弹丸之地\"，打出了\"海上马车夫\"的称号，奠定了荷兰海上霸主的地位。
仅仅凭借香料，便让荷兰如此富裕，更何况中国的茶叶、瓷器与丝绸，具让荷兰渴望无比。荷兰商人开出很高的价钱收购这些\"中国特产\"，在巨大的利润之下，即便明朝有海禁政策，浙江、福建一带的海商活动从未停止。
郑氏集团就是众多海商之一，与日本、荷兰交易往来密切，郑成功的母亲田川氏，就是正儿八经的日本人。而后，郑氏集团做到了龙头老大的地位，可谓是东南沿海一霸。
郑家在海边叱咤风云，赚得盆满钵满。大明朝却并没有做出相应的整治措施，这因为当时的明朝已经自顾不暇。此时崇祯当政，明朝内有农民起义，社会动荡不安；外有清军吞并蒙古，像一头猛兽一样趴在大明的脊梁上，虎视眈眈。
偏安一隅的郑氏集团目睹了大明的种种动荡，抛去郑氏集团种种违禁的海上贸易活动。郑成功生于明朝，长于明朝，有一腔忠君爱国之心，见到国家动荡，他毅然地站了出来。
郑成功打着大明的旗号，在福建沿海一带抵御清军，一度攻入过南京。只是愈进行胶着，郑成功愈是看清，大明气数已尽，清军的大势不可阻挡，负隅顽抗已经没有意义。
一腔抱负无处施展，郑成功万分不甘心的撤军。回到福建一带时，遥望着台湾海峡，郑成功突然想到，台湾此时还