当乐乐将四晶能量注入金色光团时，光团突然炸开，化作一道金色的阶梯，通向圣殿顶端的水晶台。水晶台上，一颗拳头大的火种正静静燃烧，火种的光芒比万族共生晶更盛，周围的星尘都在围绕它旋转——这就是元初光种。可就在乐乐伸手触碰光种的瞬间，整个圣殿突然剧烈震动，殿外传来凯伦焦急的通讯：“乐乐，大量混沌舰队从深渊出来了！它们的目标是圣殿，想毁掉元初光种！”
“共生号”的警报声立刻响起。雷达屏幕上，无数艘黑色的混沌战舰正朝着圣殿驶来，舰首的主炮正凝聚紫色能量。阿水立刻操控“共生号”展开防御屏障：“这些战舰的能量比之前的寂灭战士强十倍！我们的屏障撑不了多久！”乐乐看着水晶台上的元初光种，突然有了主意：“张博士，能不能将光种的能量暂时导入‘共生号’的主炮？用它的光芒击退混沌舰队！”
“可以是可以，但光种还没完全激活，强行抽取能量会损伤它！”张博士的手指在控制台上飞快操作，“最多只能发射一次，而且发射后光种会陷入休眠，需要三天时间才能重新激活！”乐乐立刻做出决定：“就这么办！先击退敌人，再唤醒光种！孩子们，用光丝固定光种，防止能量抽取时发生爆炸！”
少年护海员们立刻用光丝将元初光种固定在水晶台上，阿水则将“共生号”的能量管道连接到水晶台，万族共生晶和光之心的能量同时注入，为光种提供稳定的能量输出。当混沌舰队的主炮即将开火时，乐乐大喊：“发射！”水晶台的能量管道瞬间亮起，一道金色的光束从“共生号”的主炮射出，光束所过之处，混沌战舰像遇到阳光的冰雪般快速消融，连能量炮的紫色光束都被彻底净化。
混沌舰队的残骸化作星尘，圣殿终于恢复了平静。元初光种的光芒果然变得黯淡，陷入了休眠。乐乐将光之心放在光种旁，光之心的能量正缓慢滋养着光种：“三天时间，足够我们做好准备了。”他打开通讯器，联系凯伦的舰队：“混沌舰队已经被击退，我们找到元初光种了，现在需要时间激活它，你们一定要守住深渊边缘的防线！”
激活光种的三天里，众人在圣殿周围布置了防御工事。胖小子带着共生族的孩子们，在圣殿外围搭建了光盾阵，光盾里融入了光种的残留能量，能自动净化靠近的混沌能量；小毛豆则将光丝与凯伦的舰队连接，形成一道预警网，只要混沌势力靠近就能第一时间发现；扎羊角辫的小女孩则每天给光种吟唱光点们留下的歌谣，光种的光芒在歌谣中逐渐变得明亮。
第三天清晨，当第一缕星光照射到圣殿时，元初光种终于重新激活。这次的光芒不再是纯粹的金色，而是融合了万族能量的彩色，光种的表面浮现出无数符文，与乐乐的四晶产生共鸣。“光种认可你了！”光之心化作无数光点，融入光种之中，“现在它的能量能与你的四晶完美契合，就算在深渊里，也能发挥出全部力量！”
就在这时，凯伦的通讯再次传来，这次的声音带着喜悦：“乐乐，好消息！万族联盟的援军到了！有机械族的巨型战甲、植物族的能量藤蔓舰，还有龙族的火焰舰队！我们的防线更稳固了！”乐乐站在圣殿顶端，看着远处星空中五彩斑斓的万族舰队，突然感到无比安心——他不是一个人在战斗，身后有无数伙伴在支持他。
返回防线的路上，“共生号”的主炮正缓慢吸收元初光种的能量，炮身的纹路变得与光种一模一样。阿水摸着炮管，兴奋地说：“有了这门‘光种炮’，就算遇到寂灭之主的主力舰队，我们也能一战！我还在炮口加装了霞光贝能量层，能让光种的光芒扩散得更远，净化更多混沌能量！”
防线基地里，万族联盟的代表们正围着星图讨论战术。机械族的代表展示着巨型战甲的设计图，战甲的核心能嵌入元初光种的能量碎片；植物族的代表则拿出一颗种子，种子能在混沌能量中生长，长出的藤蔓能缠住混沌战舰；龙族的代表喷出一团火焰，火焰中带着纯净的能量，能直接焚烧混沌能量：“我们各族的力量单独使用都有限，但联合起来，就能形成‘万族净化阵’，彻底包围寂灭深渊！”
乐乐将元初光种放在星图中央，光种的光芒在星图上勾勒出一条深入深渊的路线，路线旁的红点正是寂灭之主的藏身之处。“根据光种的感应，寂灭之主正在深渊核心凝聚能量，准备将整个深渊变成移动的混沌堡垒。”乐乐的手指顺着路线移动，“我们的计划是：凯伦带领舰队从正面吸引火力，机械族和龙族从两侧包抄，植物族用藤蔓封锁深渊出口，防止寂灭之主逃跑，我带着‘共生号’和光种，从路线最薄弱的地方进入核心，用元初光种净化它的晶核。”
会议结束后，乐乐独自来到“共生号”的甲板上。小珍珠从星际跳跃通道一路跟随而来，此刻正围着元初光种跳跃，背鳍的