三人顺着能量波动的方向追踪而去，来到了一个偏远的星系。这个星系中的星球大多荒芜破败，似乎经历过一场惨烈的灾难。在一颗死寂星球的废墟中，他们发现了一个隐藏在地下的神秘基地。基地周围弥漫着一层淡淡的黑暗能量，若不仔细观察，很难发现其存在。
萧刻奥特曼等人小心翼翼地潜入基地。基地内部阴暗潮湿，墙壁上闪烁着诡异的幽光。他们在通道中前行，时不时会遇到一些自动防御装置的攻击。这些装置的攻击方式虽然简单，但数量众多，让人应接不暇。
“这些防御装置看起来像是暗域的技术，但又有些粗糙，不像是他们的核心力量。”艾克斯奥特曼一边利用数据化能力破解防御装置，一边分析道。
继续深入基地，他们听到了一阵低沉的咆哮声。随着声音越来越近，一个巨大的身影出现在他们面前。这是一只外形类似恐龙的怪兽，但它的身上覆盖着黑色的鳞片，眼睛闪烁着诡异的紫色光芒，嘴里不断喷出黑色的烟雾。
“小心，这只怪兽身上的黑暗能量很强！”萧刻奥特曼提醒道。
泰罗奥特曼率先发动攻击，他释放出斯特利姆光线，光线如同一道炽热的光束射向怪兽。然而，怪兽张开嘴巴，将斯特利姆光线一口吞下，不仅没有受到伤害，反而变得更加狂暴。
艾克斯奥特曼见状，利用数据化能力将周围的金属碎片转化为武器，向怪兽投掷过去。金属碎片击中怪兽后，却被它身上的鳞片弹开。
萧刻奥特曼沉思片刻，他发现怪兽每次攻击时，身上的鳞片会出现短暂的缝隙。“攻击它鳞片的缝隙！那可能是它的弱点！”萧刻奥特曼大喊道。
三人立刻调整攻击策略，集中力量攻击怪兽鳞片的缝隙。在他们的合力攻击下，怪兽的鳞片开始出现破损，身上的黑暗能量也逐渐减弱。
就在他们即将击败怪兽时，基地突然剧烈震动起来。周围的墙壁开始崩塌，地面出现一道道裂痕。一个神秘的声音在基地中回荡：“愚蠢的奥特曼，你们以为能轻易破坏我的计划吗？”
萧刻奥特曼大声问道：“你是谁？这里又是什么地方？”
神秘声音冷笑道：“我是暗域的余孽，这里是我们新的实验基地。你们的出现，正好可以帮我测试新的武器。”
话音刚落，基地中涌出一群机械生物。这些机械生物体型较小，但行动敏捷，它们的身上配备着各种能量武器，对着萧刻奥特曼等人疯狂扫射。
萧刻奥特曼释放出屏障抵挡攻击，泰罗奥特曼和艾克斯奥特曼则反击机械生物。在战斗中，萧刻奥特曼发现这些机械生物的攻击频率和能量输出似乎受到某种信号的控制。
“艾克斯，你尝试干扰它们的控制信号，我和泰罗负责攻击！”萧刻奥特曼说道。
艾克斯奥特曼点头，利用数据化能力侵入机械生物的控制系统。经过一番努力，他成功干扰了控制信号，机械生物的行动变得混乱起来。
萧刻奥特曼和泰罗奥特曼抓住机会，发动猛烈攻击，将机械生物一一摧毁。解决了机械生物后，他们继续寻找神秘声音的来源。
在基地的最深处，他们发现了一个巨大的实验室。实验室中摆放着各种奇怪的仪器和实验样本，中央的一个巨大容器中，浸泡着一块散发着强烈黑暗能量的晶体。这块晶体与“混沌初开”石板的气息极为相似，似乎是石板力量的一种衍生。
“看来这就是他们新计划的关键。”萧刻奥特曼说道。
就在这时，神秘声音再次响起：“没错，这是我们利用石板碎片研究出的混沌结晶。只要将它完全激活，就能再次开启暗域的力量，让宇宙陷入黑暗！”
萧刻奥特曼等人意识到情况危急，他们必须阻止神秘人激活混沌结晶。突然，一个身影从黑暗中冲了出来，正是之前与他们战斗的那只怪兽。此时的怪兽经过强化，实力更加强大。
萧刻奥特曼、泰罗奥特曼和艾克斯奥特曼再次与怪兽展开战斗。这一次，怪兽的攻击更加猛烈，它的速度也变得更快，让他们有些难以招架。
在战斗中，萧刻奥特曼发现怪兽对混沌结晶的能量波动十分敏感。每当混沌结晶的能量增强，怪兽的力量也会随之提升。
“我们不能让混沌结晶的能量继续增强！泰罗，你负责牵制怪兽，我和艾克斯去破坏混沌结晶！”萧刻奥特曼说道。
泰罗奥特曼点头，释放出奥特炸弹，将怪兽暂时困住。萧刻奥特曼和艾克斯奥特曼趁机冲向混沌结晶。
混沌结晶周围设置了一层强大的能量护盾，萧刻奥特曼和艾克斯奥特曼尝试用各种方法突破护盾，但都没有成功。
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“这护盾太强大了，我们必须想个办法。”艾克斯奥特曼说道。
萧刻奥特曼突然想起了之前在暗域核心战斗时，泽塔星能量结晶与自己力量融合的情景。他拿出能量结晶，将其靠近护盾。能量结晶与护盾产生了一种奇妙的