联邦太空舰队的编制和舰种也需要进行相对的变化，针对现在地球联邦舰队的特点和优势，联邦军部对舰队的编成进行了相当的变动。

    首先是舰队的规模，以前的联邦舰队，每只舰队大约拥有大小战舰约三百五十艘，其中大半都是驱逐舰和护卫舰，而在和外星舰队的战斗中表明，小型舰艇的作用主要是近空防御，在对抗敌人主力舰中并没有什么作用，而近空防御的任务可以由无人机母舰，太空母舰来兼职，所以舰队中的护卫舰尤其是护卫艇的存在价值被大大消弱，再加上护卫艇的防御力不足，容易被击毁，生存力太差的问题被暴漏了出来。

    所以舰队改变的核心之一就是调整舰队的战舰中和类结构，增加主力舰的比例，同时装备防空型驱逐舰来替代小型的护卫舰，而主力舰中的巡洋舰和战列舰的比例从之前的百分之八提高到百分之十五，几乎是提高了一倍，同时表现不错的等离子炮驱逐舰也得到了加强，数量稳步上升，再加上新的防空驱逐舰组成了主要的中型战舰群体。

    然后就是舰队的另外一个核心，无人机母舰和太空母舰，经过大改的熊猫战斗机三代目，可以协同两架精神力僚机战斗的全新熊猫战斗机终于登场了。